关于棉花生产成本的最新ICAC调查表明杂草控制变得越来越昂贵。杂草控制成本包括手动/机械除草，稀疏（也补充杂草），锄头和除草剂使用。2000/10年度杂草控制的支出从2000/01年度的每公斤棉绒产量增加到21美分，并在2012/13年度每公斤31美分。（这些成本估算不适合通货膨胀。）
占棉花生产净成本的百分比，与杂草控制相关的支出从2000/01年的11％上升到2012/13年的20％。（净成本是不包括土地租金的总成本和棉籽的价值。）杂草控制成本作为2012/13年棉花产量净成本的最昂贵的成本，甚至比收获和轧花更昂贵。
有效的杂草控制对于实现高收益率至关重要。如果杂草没有快速删除，他们会消耗输入和挤出棉花植物的增长。如果允许通过本赛季一直站立收获，杂草也干扰挑选并导致垃圾和染色增加。
廉政公署秘书处技术信息科负责人Rafiq Chaudhry博士指出，采用除草剂耐受循环准备和圆润的弯曲棉花品种可能导致杂草控制的支出更高。
Chaudhry博士解释说除草剂耐受性的存在鼓励除草剂使用。他进一步观察到，随着除草剂耐受生物技术棉花，农民往往将除草剂施用，因为棉花生长，而没有生物技术农民被迫使用出苗前的杂草控制措施。他指出，在非生物技术棉花中使用的除草剂正在扩大。
调查结果表明，与文化控制和手动杂草相关的成本似乎也在增加，以及使用除草剂。有可能使用生物技术抗虫棉花品种正在降低昆虫控制成本，并为杂草控制提供更多资源。
