由于粉虱的袭击，旁遮普邦和哈里亚纳邦的棉花作物遭到了大规模破坏，引发了关于抗虫棉是否适合印度的争论。 旁遮普邦的粉虱已将三分之二的棉花作物毁灭。该州的棉花种植面积超过120万英亩，其中大部分为Bt棉花品种。据媒体报道，从某种程度上讲，损失已经固定在420亿卢比，并且有12多个农民因农作物损失而自杀。活动家将自杀归咎于作物受损。 孟山都的科学家对转基因棉花进行了调整，以生产自己的杀虫剂以杀死诸如棉铃虫的害虫。但是两年的干旱促进了粉虱的传播，而该菌株没有抵抗力。带翼的害虫通过吸出液体损害棉株的叶子。农民声称他们喷洒了不同种类的农药，但没有一个起作用。农民现在担心这些害虫可能侵袭其他农作物，例如辣椒，蔬菜，从而导致进一步的损失。 印度Mahyco与孟山都当地子公司之间的合资企业已将其Bt棉株的生产许可转包给28家种子公司，该Bt棉株于2002年首次在印度出售。孟山都公司声称，除了喷洒批准的农药外，还没有解决粉虱侵扰的解决方案。 Bt种子的成本要比旧棉株高，因此每年必须由农民购买。销售转基因棉花的公司表示，由于收成更高，可以节省农药，种植者的境况会更好，但一些农民团体担心对新品种的依赖性增加。 Bharatiya Kisan Sangh正在加紧反对。它希望禁止Bt棉花，并且正试图阻止诸如转基因芥末（一种油料种子）等作物的引进。它希望政府在所有转基因种子投放市场之前对其进行测试。 尚无该国其他地区发生粉虱袭击的报道，尽管当地遭受了严重破坏，但旁遮普邦和哈里亚纳邦的侵扰不太可能对国家产量产生重大影响。
印度的棉花种植面积为11-12百万公顷，其中近95％是转基因棉花。
由环境活动家范达纳·希瓦（Vandana Shiva）领导的绿色非政府组织Navdanya指责转基因种子公司以“虚假”承诺“诱骗”农民，并要求公平补偿和推广当地种子，以防止再次发生“灾难”。 它在一份声明中说：“ Navdanya反对旁遮普农民受害，这些旁遮普农民受到转基因种子公司的诱骗”，虚假承诺每英亩产量800公斤。
